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Plateforme PETAR

PIGNOL Cécile

Laboratoire sédimentologie & Plateforme CTI4D

Ingénieur d’étude USMB

Plateforme « PETAR »

Coordonnées :

Université de Savoie
Laboratoire EDYTEM - UMR 5204 du CNRS
« Environnements, Dynamiques et Territoires de la Montagne »
Bâtiment Pôle Montagne
F-73376 LE BOURGET DU LAC Cédex

Téléphone : : 04 79 75 88 89
Courriel : cecile.pignol univ-savoie.fr


Mots clés : Sédimentologie, Suivi de projet, Gestion d’échantillons, Banque de données, SIG, Plan Management Données (DMP)


ACTIVITÉ DANS LE LABORATOIRE

J’assure au sein de la plateforme PETAR la collecte, la gestion conservatoire et l’accessibilité des informations et des données thématiques et spatiales en vue de leur analyse et traitement. Cette mission concerne des données géographiques et des échantillons physiques géolocalisés et le produit de leur traitement. Ce travail s’effectue au sein de réseaux locaux, nationaux et internationaux, en cohérence avec la mise en libre accès des données issues de la recherche publique. A ce titre, cette mission participera à la diffusion et à la valorisation des données acquises par le laboratoire EDYTEM Par ailleurs, ma mission contribue à l’articulation des deux pôles technologiques du laboratoire (Géomatériaux et Cartographie Topographie Imagerie 4D).

ACTIVITÉS SUR LA PLATEFORME

ARCHIVE NATURELLES

  • Gestion du workflow des échantillons aux données
  • Maintien des appareils et consommables
  • Accompagnement des visiteurs extérieurs Activités en collaboration d’ A-L DEVELLE - Responsable Core-scan http://edytem.univ-savoie.fr/annuai...

CTI4D

  • Orienter les utilisateurs dans la recherche de données spatialisées provenant de fournisseurs extérieurs et/ou étrangers
  • Participer à l’autonomisation des membres du laboratoire dans le traitement des données spatialisées
  • Assister, suivre des tâches de mise en forme et d’édition de données cartographiques

OPENDATA - VEILLE TECHNO

  • Standard et outils d’interopérabilité et de diffusion de données
  • Plan de Management de Données

ACTIVITÉS D’ENSEIGNEMENT

  • Accueil des étudiants et stagiaires
  • Formation aux activités du laboratoire de sédimentologie ou SIG

CLIMCOR

Le projet CLIMCOR (Equipex CLIMCOR - ANR-11-EQPX-0009-CLIMCOR) vise à fournir à la communauté scientifique française un soutien technologique de haut niveau. CLIMCOR placera la communauté scientifique française dans une position concurrentielle au niveau international. Plus d’information ici :
Site WEB du projet CLIMCOR http://climcor-equipex.dt.insu.cnrs.fr/

Site WEB du Centre de Carottage et de Forage National - C2FN http://c2fn.dt.insu.cnrs.fr/spip/

Le Cyber-carothèque nationale S/c CLIMCOR WK Package « Continent »

La cyber-carothèque nationale est une initiative du C2FN développée dans le cadre du projet Equipex CLIMCOR (ANR-11-EQPX-0009-CLIMCOR), dans le cadre du WK Package « Continent », sous la direction de Fabien Arnaud (DR CNRS) et Laurent Augustin (IR CNRS).

La version de démonstration (Maquette de la cyber-carothèque), présentée pour la première fois au colloque Resomar (version 1.0, basée sur une architecture améliorée du portail existant GEOSCIENCES - de l’UMR EPOC et de différents retours d’expérience au MNHN (GEOCORES), EDYTEM (BDD « RM ») et IFREMER (BGMB) : Cette maquette vise à démontrer l’intérêt d’une telle approche et à tester l’interface permettant la recherche des enregistrements sédimentaires prélevés par la communauté nationale des chercheurs en paléo-environnement et stockées dans diverses carothèques de laboratoire de recherche français.
Site WEB du projet de Cyber-carothèque nationale http://www.climcor-cyber.fr/cores/

L’objectif est de stimuler les communautés (Glace, Continent et Océan) à entrer en 2015 dans une nouvelle ère ou la gestion conservatoire des échantillons ne serait plus perçue comme une contrainte mais comme un atout pour l’accès, le partage et le suivi des prélèvements et des données. Communication :
Colloque RESOMAR 214 : Le projet de la Cyber-carothèque nationale http://resomar.cnrs.fr/spip.php?art...

Responsable : Fabien ARNAUD, EDYTEM Correspondant plateforme PETAR : Cécile Pignol, EDYTEM

INTER ZONES-ATELIERS

Pour des recherches sur l’environnement et les anthroposystèmes en relation avec les enjeux sociétaux Les Zones Ateliers (USR 3613 ZA) forment un vaste réseau inter-organismes de recherches interdisciplinaires sur l’environnement et les anthroposystèmes en relation avec les questions sociétales d’intérêt national. Douze sont actuellement en activité et un réseau inter ZA sur la ville est en cours de construction en collaboration avec le site LTER de Baltimore. Le réseau des Zones Ateliers est désormais membre du LTER Europe et du ILTER pour l’international. Leur spécificité réside dans la taille de l’objet d’étude, qui est de dimension régionale. Leur problématique est celle des interactions entre un milieu et les sociétés qui l’occupent et l’exploitent. http://www.za-inee.org/

2014 : Projet Inter-ZA sur les Archives sédimentaires

L’action transversale inter-ZA 2014 sur les archives sédimentaires a été lancée lors du Conseil Scientifique des Zones Ateliers qui s’est tenu à Nancy en février 2014. Cette action a concerné une trentaine de participants venant de huit Zones Atelier (Alpes, Arc Jurassien, Armorique, Brest-Iroise, Moselle, Loire, Bassin du Rhône et Seine). Un comité de pilotage restreint composé d’une personne référente par ZA participante a été mis en place pour organiser cette action.

Dans ce contexte, les trois objectifs de cette action inter-ZA ont été :
- 1. de dresser un bilan des archives sédimentaires disponibles dans le réseau des Zones Ateliers en vue de constituer une base de métadonnées en lien avec les cyber-carothèque nationale du C2FN (ANR CLIMCOR) ;
- 2. de compléter les informations sur les carottes sédimentaires existantes en finançant un ensemble d’analyses (datations, paléo-microfossiles, biogéochimie, imagerie) ;
- 3. d’animer un groupe de réflexions/discussions sur les perspectives de travail.

2015-2016 : Projet Inter-ZA « ROZA » ROZA, est un projet fédératif pluriannuel, vise à favoriser la réutilisation et la méta-analyse des archives naturelles étudiées au sein des ZAs, au-delà de la communauté classique des paléosciences. ROZA sera une banque d’échantillons et de données géoréférencés (métadonnées de collecte), chronoréférencés (datation) et transposables (réutilisation des données acquises sur de nouveaux prélèvement) sans équivalent de par le monde. Les moyens seront affectés à du réseautage et de l’analyse pour homogénéiser les séquences. Les attendus sont une augmentation notable de la réutilisation des données issues des ZAs et l’émergence de projets inédits de méta-analyses. Pour cela, ROZA sera connecté à la cyber-carothèque national et interopérable avec le nouveau portail des ZAs. Il pourra être étendu à l’échelle européenne voire internationale, potentiellement via DEIMS.

Responsable : Fabien ARNAUD, EDYTEM Correspondant plateforme PETAR : Cécile Pignol, EDYTEM

ANR IPER-RETRO

Le projet ANR IPER-RETRO vise à combiner les outils paléo-limnologiques et écologiques dans l’objectif d’étudier 150 années de réponses des lacs péri-alpins à l’introduction de poissons, aux changements de statuts trophiques et au changement climatique.

Site WEB du projet ANR http://www.inra.fr/iper_retro

Work-Package 2 « IPER-RETRO ». Sédimentologie et l’étude du compartiment abiotique

Les sédiments lacustres enregistrent potentiellement les changements internes et externes de l’environnement lacustre. L’objectif de ce WP est de fournir une reconstruction précise des conditions physiques et chimiques qui régnaient dans les lacs. Il s’agit d’un point critique pour replacer les modifications des compartiments biotiques en relation avec leur environnement.

Responsable du WP 2 : Fabien ARNAUD, EDYTEM
Correspondant plateforme PETAR : Cécile Pignol, EDYTEM


Publications

2017

Article dans une revue

titre
Progressive and regressive soil evolution phases in the Anthropocene
auteur
Manon Bajard, Jérôme Poulenard, Pierre Sabatier, Anne-Lise Develle, Charline Giguet-Covex, Jérémy Jacob, Christian Crouzet, Fernand David, Cécile Pignol, Fabien Arnaud
article
CATENA, Elsevier, 2017, 150, pp.39 - 52. 〈10.1016/j.catena.2016.11.001〉
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2016

Article dans une revue

titre
Long-term dynamics in microbial eukaryotes communities: a palaeolimnological view based on sedimentary DNA
auteur
Éric Capo, Didier Debroas, Fabien Arnaud, Typhaine Guillemot, Vincent Bichet, Laurent Millet, Emilie Gauthier, Charly Massa, Anne-Lise Develle, Cécile Pignol, Franck Lezjerowicz, Isabelle Domaizon
article
Molecular Ecology, Wiley, 2016, 25 (23), pp.5925-5943 <10.1111/mec.13893>
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titre
Erosion under climate and human pressures: An alpine lake sediment perspective
auteur
Fabien Arnaud, Jérôme Poulenard, Charline Giguet-Covex, Bruno Wilhelm, Sidonie Révillon, Jean-Philippe Jenny, Marie Revel, Dirk Enters, Manon Bajard, Laurent Fouinat, Elise Doyen, Anaëlle Simonneau, Cécile Pignol, Emmanuel Chapron, Boris Vannière, Pierre Sabatier
article
Quaternary Science Reviews, Elsevier, 2016, 152, pp.1 - 18. 〈10.1016/j.quascirev.2016.09.018〉
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https://hal-insu.archives-ouvertes.fr/insu-01375648/file/A67_Arnaud%20et%20al_QSR_2016._cor.pdf BibTex

2015

Article dans une revue

titre
Historical Profiles of PCB in Dated Sediment Cores Suggest Recent Lake Contamination through the “Halo Effect”
auteur
Emmanuel Naffrechoux, Nathalie Cottin, Cécile Pignol, Fabien Arnaud, Jean-Philippe Jenny, Marie-Elodie Perga
article
Critical Reviews in Environmental Science and Technology, Taylor & Francis, 2015, 49 (3), pp.1303-1310. 〈10.1021/es5043996〉
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2014

Article dans une revue

titre
Long-term relationships among pesticide applications, mobility, and soil erosion in a vineyard watershed
auteur
Pierre Sabatier, Jérôme Poulenard, Bernard Fanget, Jean-Louis Reyss, Anne-Lise Develle, Bruno Wilhelm, Estelle Ployon, Cécile Pignol, Emmanuel Naffrechoux, Jean-Marcel Dorioz, Bernard Montuelle, Fabien Arnaud
article
Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America , National Academy of Sciences, 2014, 111 (4), pp.15647-15652. 〈10.1073/pnas.1411512111〉
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Chapitre d'ouvrage

titre
La plateforme GéMo : Monitoring, échantillonnage et caractérisation des Géomatériaux.
auteur
Anne-Lise Develle, Emmanuel Malet, Cécile Pignol, Fayçal Soufi, Vincent Blanc, Bernard Fanget
article
Environnements, Dynamiques et Territoires de la montagne, Collection EDYTEM, pp.153-162, 2014, Collection EDYTEM n°16
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titre
Les Bases de Données : Données géographiques acquises et données produites
auteur
Estelle Ployon, Cécile Pignol, Bruno Galabertier
article
Environnements, Dynamiques et Territoires de la montagne, Collection EDYTEM, 7p., 2014, Collection EDYTEM n°16
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titre
L'objet emblématique Lacs de Montagne : L'étude des sédiments lacustres au laboratoire EDYTEM.
auteur
Fabien Arnaud, Charline Giguet-Covex, Bruno Wilhelm, J.P. Jenny, Pierre Sabatier, Jérôme Poulenard, M. Desmet, D. Enters, S. Révillon, L. Millet, M. Debret, Cécile Pignol, E. Malet, Bernard Fanget
article
Environnements, Dynamiques et Territoires de la montagne, Collection EDYTEM, pp. 107-118, 2014, Collection EDYTEM n°16
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2013

Article dans une revue

titre
A spatiotemporal investigation of varved sediments highlights the dynamics of hypolimnetic hypoxia in a large hard-water lake over the last 150 years
auteur
Jean-Philippe Jenny, Fabien Arnaud, Jean-Marcel Dorioz, Charline Giguet-Covex, Victor Frossard, Pierre Sabatier, Laurent Millet, Jean-Louis Reyss, Tachikawa Kazuyo, Edouard Bard, Cécile Pignol, Fayçal Soufi, Olivier Romeyer, Marie Elodie Perga
article
Limnology and Oceanography, Association for the Sciences of Limnology and Oceanography, 2013, 58 (4), pp. 1395-1408. 〈10.4319/lo.2013.58.4.1395〉
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titre
DNA from lake sediments reveals the long-term dynamics and diversity of Synechococcus assemblages
auteur
Isabelle Domaizon, Olga Savichtcheva, Didier Debroas, Fabien Arnaud, Clement Villar, Cécile Pignol, Benjamin Alric, Marie Elodie Perga
article
Biogeosciences, European Geosciences Union, 2013, p. 3817-3838. 〈10.5194/bg-10-3817-2013〉
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titre
Sentinel lakes: a network for the study and management of mountain lakes in the French Alps and in Corsica
auteur
C. Birck, I. Epaillard, M.-F. Leccia, C. Crassous, A. Morand, C. Miaud, C. Bertrand, L. Cavalli, S. Jacquet, P. Moullec, R. Bonnet, C. Sagot, E. Franquet, Y.M. Nellier, M.E. Perga, N. Cottin, Cécile Pignol, Emmanuel Malet, E. Naffrechoux, Charline Giguet-Covex, Isabelle Jouffroy-Bapicot, D. Etienne, L. Millet, Pierre Sabatier, Bruno Wilhelm, B. Perren, Fabien Arnaud
article
Eco-Mont, 2013, 5 (1), pp.41-46
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titre
Local forcings affect lake zooplankton vulnerability and response to climate warming
auteur
Benjamin Alric, Jean-Philippe Jenny, Vincent Berthon, Fabien Arnaud, Cécile Pignol, Jean-Louis Reyss, Pierre Sabatier, Marie Elodie Perga
article
Ecology, Ecological Society of America, 2013, 94 (12), pp. 2767-2780. 〈10.1890/12-1903.1〉
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titre
Palaeoflood activity and climate change over the last 1400 years recorded by lake sediments in the north-west European Alps
auteur
Bruno Wilhelm, Fabien Arnaud, Pierre Sabatier, Olivier Magand, Emmanuel Chapron, Thierry Courp, Kazuyo Tachikawa, Bernard Fanget, Emmanuel Malet, Cécile Pignol, Edouard Bard, Jean-Jacques Delannoy
article
Journal of Quaternary Science, Wiley, 2013, 28 (2), pp. 189-199. 〈10.1002/jqs.2609〉
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https://hal.archives-ouvertes.fr/halsde-00799655/file/Wilhelm_et_al_JQS_2013_R2.pdf BibTex

Communication dans un congrès

titre
Histoire des activités agro-pastorale et des paysages de montagne révélée par l'ADN sédimentaire lacustre.
auteur
Charline Giguet-Covex, Johan Pansu, Jérôme Poulenard, Fabien Arnaud, Pierre Sabatier, Manon Bajard, Fernand David, Anne-Lise Develle, Cécile Pignol, Philippe Choler, Pierre Taberlet
article
14ème congrès français de sédimentologie, Nov 2013, Paris, France
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titre
La gestion et valorisation des données issues de carottes sédimentaires terrestres en France: vers la professionnalisation et la mutualisation de moyens
auteur
Cécile Pignol, Fabien Arnaud, Marie Elodie Perga, Bruno Galabertier, Bernard Fanget, Michel Calzas, Laurent Augustin
article
14e congrès français de sédimentologie, 2013, France
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2012

Communication dans un congrès

titre
Toward a quantitative reconstruction of hypoxia from varve records in the large perialpin Lake Bourget over the last 150 years
auteur
Jean-Philippe Jenny, Fabien Arnaud, Jean-Marcel Dorioz, Charline Giguet-Covex, Victor Frossard, Pierre Sabatier, Laurent Millet, Valérie Verneaux, Jean-Louis Reyss, Kazuyo Tachikawa, Olivier Romeyer, Cécile Pignol, Marie Elodie Perga, Emmanuel Malet
article
European Geosciences Union (EGU), Apr 2012, Vienne, Austria
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titre
Long term dynamics and diversity of freshwater picocyanobacteria: Coupling between molecular tool and paleolimniological approach
auteur
Isabelle Domaizon, Olga Savichtcheva, Didier Debroas, Clement Villar, Cécile Pignol, Jean-Philippe Jenny, Fabien Arnaud, Marie-Elodie Perga
article
International paleolimnology symposium, 2012, Glasgow, United Kingdom
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titre
Gliding from limnology to paleolimnology to study the ecosystem-wide consequences of human pressures on lake food webs
auteur
Marie-Elodie Perga, Benjamin Alric, Fabien Arnaud, Vincent Berthon, Didier Debroas, Isabelle Domaizon, Victor Frossard, Jean-Philippe Jenny, Amy Kirkham, Laurent Millet, Cécile Pignol, Jean-Louis Reyss, Olga Savichtcheva, Florence Sylvestre, Valérie Verneaux
article
International paleolimnology symposium, 2012, Glasgow, United Kingdom
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titre
3D reconstruction of hypoxia from varve records in three large perialpine Lakes - Bourget, Annecy and Geneva (France - Switzerland) - over the last 100 years
auteur
Jean-Philippe Jenny, Fabien Arnaud, Jean-Marcel Dorioz, Charline Giguet-Covex, Pierre Sabatier, Jean-Louis Reyss, Cécile Pignol, Marie-Elodie Perga
article
International paleolimnology symposium, 2012, Glasgow, United Kingdom
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2011

Communication dans un congrès

titre
Historical contamination of three french peri-alpines lakes sediments by PCBs : influence of local sources and watershed characteristics
auteur
Nathalie Cottin, Emilie Chalmin, Jean-Philippe Jenny, Cécile Pignol, Marie Elodie Perga, Emmanuel Naffrechoux
article
12th European Meeting on Environmental Chemistry,, Dec 2011, Clermont Ferrand, France. 2011
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titre
300 years of underflow record in Lake Bourget: an attempt of quantitative hydrological reconstruction based on spatio-temporal approach
auteur
Jean-Philippe Jenny, Fabien Arnaud, Jean-Marcel Dorioz, Charline Giguet-Covex, Pierre Sabatier, Cécile Pignol, Emmanuel Malet, Jérome Lazarotto, Jean-Louis Reyss, Olivier Romeyer
article
13e Congrès Français de Sédimentologie, 2011, Dijon, France
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titre
Analyse préliminaire du signal magnétique enregistré par les sédiments postglaciaires du lac de La Thuile (Savoie)
auteur
Christian Crouzet, Fabien Arnaud, Cécile Pignol, Pierre Sabatier
article
13e Congrès Français de Sédimentologie, 2011, Dijon, France
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titre
300 years of underflow record in Lake Bourget: an attempt of quantitative hydrological reconstruction based on spatio-temporal approach
auteur
Jean-Philippe Jenny, Fabien Arnaud, Jean-Marcel Dorioz, Charline Giguet-Covex, Pierre Sabatier, Cécile Pignol, Emmanuel Malet, Jérome Lazarotto, Jean-Louis Reyss, Olivier Romeyer, Marie Elodie Perga
article
International Limnogeology Congress, 2011, Konstanz, Germany
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2010

Communication dans un congrès

titre
Evolution spatio-temporelle de l'oxygenation de l'hypolimnion sous controle du niveau trophique et des crues rhodaniennes dans le lac du bourget depuis 150 ans
auteur
Jean-Philippe Jenny, Fabien Arnaud, Jean-Marcel Dorioz, Charline Giguet-Covex, Cécile Pignol, Emmanuel Malet, Catherine Gaume, Jérôme Lazzaroto, Jean-Louis Reyss, Olivier Romeyer
article
Journées internationales de Limnologie, 2010, Thonon, France
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